介绍Windows系统自带的软件,包括给视频/音频添加同步字幕的软件(快捷键:Windows+Ctrl+L),以及实时转换语音成文本的软件(快捷键:Windows+H)。
离线转录视频/音频成文本的软件
介绍把语音或视频转录成文本的开源软件 Open AI的Whisper,以及基于Whisper开发的Buzz。
从NCBI的SRA数据库下载原始测序数据
记录从NCBI的SRA数据库下载原始测序reads数据(二代数据和三代数据),并转换为fastq格式的方法。
Linux系统中所有环境变量失效的修复方案
Linux系统下环境变量PATH设置错误导致所有环境变量异常,所有命令失效,记录修复方案。
加拿大工作签证办理流程:LMIA-Exempt Work Permit
记录2025年上半年申请加拿大的工作签证的流程,加拿大博士后属于雇主指定工作许可(Employer-specific Work Permit)中的豁免劳动力市场影响评估的工作签证(LMIA-Exempt Work Permit)。
用GetOrganelle组装细胞器基因组或核基因组的核糖体RNA序列
介绍GetOrganelle,使用GetOrganelle基于whole genome skimming data组装植物质体、植物线粒体、动物线粒体、真菌线粒体、核基因组的核糖体RNA(18S-ITS1-5.8S-ITS2-26S)等序列。
细胞器基因组组装过程中常用软件Bandage的操作
记录细胞器基因组组装过程中常用软件Bandage的操作。
提交原始测序数据到NCBI的SRA数据库
记录上传原始测序reads数据(二代数据和三代数据)到SRA数据库的步骤。
提交核苷酸序列到NCBI的GenBank的介绍
介绍NCBI,GenBank和向GenBank上传核苷酸序列。
二代测序数据的前处理
对二代测序进行预处理。包括从NCBI下载SRA格式数据,把SRA格式转为fastq格式。对二代测序的下机数据的质控,包括fastp去除接头和低质量序列,fastqc获取质量报告,trimmomatic去除接头和低质量序列,fastuniq为genome survey等情况去除重复序列。