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介绍KMC，用KMC做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计。

介绍jellyfish，用jellyfish做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计。

基因组调查(genome survey)的概念和方法，k-mer分析的原理，利用k-mer分析来进行基因组调查（估计基因组大小，杂合度，重复序列占比等基本信息），以及简介做基因组调查的软件。

介绍GFF3格式文件处理软件 —— GFF3toolkit工具包，包括检测GFF3格式错误，修正GFF3格式错误，合并GFF3格式文件，排序GFF3格式文件，用GFF3格式文件生成序列等。

记录Linux运维中CPU相关概念和查看CPU的命令

记录Linux运维命令 —— top的参数和用法

介绍了富集分析R包clusterProfiler富集结果的可视化，以及其他富集分析结果使用clusterProfiler进行可视化的操作。

记录使用clusterProfiler进行GO/KEGG富集分析时，根据分析的物种来选择和准备背景数据集，包括支持的模式物种的获取，非模式物种Orgdb包的构建，通用富集分析等。

使用Infernal软件对Rfam数据库比对实现基因组非编码RNA的注释

这篇博客是记录日常博客撰写过程中的语法和技巧，markdown的使用，hexo的使用，next主题的使用等。目前记录了在博客中插入图片，音乐和引用的方式。