生信技工

介绍Smudgeplot，用Smudgeplot估计物种的倍性。

记录了软件Quartet Sampling的原理和使用。

记录了热图基本概念，热图的分类，以及用R包pheatmap和ggplot2绘制网格热图的代码。

此博客记录了鉴定全基因复制事件(WGD)后保留的复制基因的背景、原理和分析步骤。

本文记录了转录因子（transcription factor，TF）的基础知识，以及使用植物转录因子数据库PlantTFDB对WGD后保留的基因进行保留率的分析的操作。

用软件PSMC推断有效群体大小的动态历史。

介绍了两个基因组间的结构变异的分析，和两个分析软件：MUM&Co和Assemblytics。

介绍了检测基因流的软件3s的原理和使用，3s基于三个物种的基因组检测两个近缘种的基因流的方向和强度。

介绍了录屏软件Xbox，OBS Studio，Captura。软件录制视频的使用和设置。

记录了使用ParaAT和KaKs_Calculator2.0批量计算基因对/序列对的Ka、Ks和4dtv的方法。