记录了基因组组装评估工具QUAST的安装和使用。
基因组组装和注释结果的整理
基因组和基因组注释的排序、重命名、合并和提取等整理操作。
基因组注释(一):重复序列注释
记录了基因组注释的第一步,重复序列的注释,转座子的相关知识,注释常用软件和用法。
基因组质量评估:(三)用BUSCO评估基因组的完整性
记录评估基因组组装和注释完整性的工具BUSCO的安装使用。
冠群(crown groups)和干群(stem groups)及相关定义
记录了冠群和干群及在古生物学和进化生物学上应用的相关概念。
同源性(homology)相关概念
解释了同源性(homology)在进化生物学应用的相关概念,包括homolog,ortholog,paralog,xenolog,analog,orthology,orthogroup,gene family。
基因组注释(三):基因功能注释
记录对基因组的基因进行功能注释的方法。
博客日常撰写和备份
这篇博客是记录博客日常撰写和备份。
在Linux系统中设置环境变量PATH
这篇博客记录了Linux系统下环境变量PATH的设置。
scripts
store some scripts using in biology and bioinformatics