生信技工

记录了两种先进行蛋白质比对，再根据蛋白质比对转换成CDS比对的软件和使用方法，转换的目的是为了增加比对精确度。

记录了分析基因家族扩张收缩的软件CAFE5的安装与使用。

从按照密码子规则（即三个三个对齐）比对的cds序列中提取四倍简并位点(fourfold degenerate codons, 4dtv)。

shell的几种循环语法的差异，循环语法内常用的命令，命令连接符和后台运行。

替换文本的换行符(replace line separator)，把多行文本变成单行文本。

记录了用R包UpSetR制作upset图展示多集合共享关系的方法。

记录了制作韦恩图(Venn Diagram)展示多集合共享关系的方法。

记录了单系、并系和复系在进化生物学上的相关概念。

记录软件WGDI的安装和使用。这里记录了WGDI用于基因组内共线性区块的鉴定，Ks计算，WGD鉴定。

记录了序列比对的概念，方法，分类，以及用于序列比对的常用软件，包括多序列比对(Multiple Sequence Alignment,MSA)及比对后过滤(trimming)的软件。