生信技工

记录软件WGDI的安装和使用。这里记录了WGDI用于基因组内共线性区块的鉴定，Ks计算，WGD鉴定。

记录了序列比对的概念，方法，分类，以及用于序列比对的常用软件，包括多序列比对(Multiple Sequence Alignment,MSA)及比对后过滤(trimming)的软件。

记录了基因组组装评估工具QUAST的安装和使用。

基因组和基因组注释的排序、重命名、合并和提取等整理操作。

记录了基因组注释的第一步，重复序列的注释，转座子的相关知识，注释常用软件和用法。

记录评估基因组组装和注释完整性的工具BUSCO的安装使用。

记录了冠群和干群及在古生物学和进化生物学上应用的相关概念。

解释了同源性(homology)在进化生物学应用的相关概念，包括homolog,ortholog,paralog,xenolog,analog,orthology,orthogroup,gene family。

记录对基因组的基因进行功能注释的方法。

这篇博客是记录博客日常撰写和备份。